"México utilizó erróneamente durante meses su sede diplomática en Quito para dar refugio a un criminal", dijo el embajador ecuatoriano, Andrés Terán.
Ecuador tendrá la oportunidad de presentar sus argumentos ante la CIJ este miércoles.
El proceso legal incluye las declaraciones injuriosas realizadas por el presidente mexicano, Manuel López Obrador, sobre las elecciones anticipadas.
Las declaraciones las virtió en una entrevista con el medio de comunicación australiano, SBS News.
El precedente que buscaría dejar el Gobierno mexicano si consigue que Ecuador sea suspendido de la ONU.
En un momento de la sesión, Ecuador proyectó un video con declaraciones del presidente mexicano, Andrés Manuel López Obrador.
"No se puede utilizar ningún pretexto, ninguna excusa para violar ningún derecho", dijo en su discurso el presidente Andrés López Obrador.
La presidenta de Honduras y actual presidenta de dicho organismo, Xiomara Castro, anunció la decisión.
En una carta, el presidente ecuatoriano describe los últimos días como una "situación compleja y sin precedentes".
La nación azteca considerará varias acciones para actuar frente a la crisis diplomática, entre ellas la presentación de una demanda.